Este texto apresenta um recorte de uma pesquisa de mestrado que buscou mapear o Estado da Arte dos saberes docentes no ensino de Ciências e Biologia em dissertações e teses produzidas no Brasil entre os anos de 2005 e 2012. No intuito de dar visibilidade a uma etapa fundamental de qualquer pesquisa, a metodologia, temos como objetivo compreender quais são as perspectivas metodológicas apresentadas por essas produções acadêmicas. O estudo é de natureza qualitativa, e o corpus de análise foi composto por trinta produções acadêmicas, sendo vinte e sete dissertações e três teses. Para a análise das informações presentes nesses documentos, empregamos a técnica de Análise de Conteúdo Temática. Na análise, identificamos o predomínio das pesquisas de natureza qualitativa e a técnica de análise que se destacou foi a Análise de Conteúdo. Foi possível perceber que os autores das produções utilizaram com bastante frequência as Unidades Didáticas e os Casos de Ensino como ferramentas de pesquisa. Além disso, os nossos dados apontam para uma fragilidade na grande maioria das produções acadêmicas analisadas, com respeito à descrição metodológica de suas pesquisas.

Palavras-chave: Ensino de Ciências e Biologia. Metodologias de pesquisa. Saberes docentes.